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메타지놈 분석 (Metagenomics)


메타유전체학 (Metagenomics)은 미생물 군집을 원래의 서식지에서 연구하여 군집 내 상호작용에 대한 종합적인 통찰을 제공합니다. 이를 통해 미생물 서식지 내 개별 종을 식별하는 데에도 활용될 수 있습니다.

샷건 메타유전체 시퀀싱 (Shotgun Metagenomics) 은 환경 샘플에서 추출한 DNA를 절단하여 작은 조각으로 시퀀싱하는 방법으로, 미생물 군집 내 종 조성뿐만 아니라 유전자 기능과 대사 경로까지 분석할 수 있습니다.

16S/18S/ITS 증폭 기반 시퀀싱 (Amplicon-based Sequencing) 은 특정 표적 영역 (앰플리콘)을 증폭하여 시퀀싱하는 방법으로, 군집 내 종 다양성과 구성을 이해하는 데 주로 사용됩니다.

기술

시퀀싱 플랫폼

ILLUMINA

NovaSeq X Plus

시스템 사양:

10B flowcell: 375G raw data per lane, ~3T raw data per Flowcell, and 2 x 150 bp read length.
25B flowcell: 1T raw data per lane, ~8T raw data per Flowcell, and 2 x 150 bp read length.

노바시크 X 플러스

PACBIO​

PacBio Revio System

시스템 사양:

N50>15kb, 90% of bases ≥Q30, 90Gb HiFi yield / SMRT Cell, 360Gb HiFi yield / run, 24-hour run times etc.

PacBio Revio 시스템

NANOPORE

Nanopore PromethION

시스템 사양:

Ultra-long reads up to 2Mb, high yields for large genomes, REAL real-time and accessible for flexible budgets.

나노포어 프로메시온

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