기술: 플랫폼
실험 플랫폼
Novogene는 미국 캘리포니아대학교 데이비스 캠퍼스를 비롯하여 영국, 독일, 싱가포르, 중국, 일본에 유전체 시퀀싱 실험실을 보유하고 있으며, 총 면적은 약 40,000㎡ 에 달합니다. 이 중에는 2,000㎡ 규모의 GMP 시설과 2,000㎡ 규모의 임상 실험실도 포함되어 있습니다.
2024년 기준, Novogene는 전 세계에 총 10개의 실험실 시설을 구축하였으며, 7,300명 이상의 글로벌 전문가와 협력하고 있습니다. 전 세계 실험실에서 연간 300만 건 이상의 샘플을 시퀀싱하고 있습니다.
Novogene Americas 시퀀싱 센터는 2016년 미국 캘리포니아대학교 데이비스(UC Davis) 내에 설립되었습니다. 현재 이 센터는 NovaSeq 6000 및 NovaSeq X Plus 시퀀싱 플랫폼을 갖추고 있으며, 북미 및 남미 지역의 연구 고객을 대상으로 NGS 서비스 및 분석을 제공합니다.
Novogene 케임브리지 시퀀싱 센터는 2018년 5월에 설립되었으며, 2019년 8월 케임브리지 사이언스 파크(Cambridge Science Park) 로 이전하였습니다. 현재 이 센터는 자동화 워크스테이션, 다수의 NovaSeq 6000 장비, 고성능 컴퓨팅 클러스터를 갖추고 있으며, GCLP 인증을 획득하였습니다. 또한, 2023년 3월 NovaSeq X Plus 시스템을 추가 도입하였습니다.
NovogeneAIT Genomics는 AITbiotech 및 싱가포르 유전체 연구소(GIS)와의 협력을 통해 아시아 태평양 지역에서 가장 규모 있는 차세대 시퀀싱(NGS) 전문 실험실 중 하나를 설립하였습니다. Novogene의 첨단 실험실은 다음과 같은 세계 최고 수준의 기술 플랫폼을 갖추고 있습니다:
- Illumina NovaSeq X Plus
- PacBio Revio
- Oxford Nanopore
- 10x Genomics Chromium Controller
- Olink 차세대 단백체 분석 플랫폼
이러한 최신 장비를 기반으로 NovogeneAIT는 아시아 태평양, 중동 및 아프리카(AMEA) 지역 고객에게 신뢰성 높고 비용 효율적인 유전체 분석 서비스를 제공합니다.
또한, Novogene의 텐진(Tianjin) 메디컬 실험실은 CAP(College of American Pathologists) 인증을 획득하였으며, 세계적 수준의 인프라를 바탕으로 임상 유전체 분석 서비스를 전 세계에 안정적으로 제공하고 있습니다.
시퀀싱 플랫폼
ILLUMINA NOVASEQ PLATFORM
- NovaSeq X Plus 10B Flow Cell을 사용하면 **최대 64개의 인간 유전체(각 90Gb)**를 최단 24시간 내에 시퀀싱할 수 있습니다.
- Lane당 약 375Gb, Flow Cell당 약 3Tb의 raw data를 생성하며, 2 × 150 bp read length를 제공합니다.
PACBIO
PACBIO REVIO PLATFORM
- Revio 시스템은 롱리드(long read), 탁월한 정확도, 직접적인 메틸화(methylation) 검출 기반 위에, 경제성, 고처리량, 사용 편의성을 더한 차세대 시퀀싱 플랫폼입니다.
- Revio는 Sequel II 시스템 대비 15배 향상된 처리량을 제공하며, 기준치의 90% 이상이 Q30 이상의 정확도, 중앙값 기준 Q30 이상의 리드 정확도를 달성할 수 있습니다.
- 25 million ZMW가 탑재된 고밀도 SMRT Cell을 사용하고, 최대 4개의 SMRT Cell을 병렬 운용, 24시간 시퀀싱을 통해 하루 최대 360 Gb의 HiFi 리드를 생성할 수 있습니다.
NANOPORE
NANOPORE PromethION PLATFORM
- Oxford Nanopore Technologies는 실시간( long-read), 직접( direct), 대규모 DNA 및 RNA 시퀀싱을 제공하는 플랫폼으로, 복잡한 유전체 분석에 적합한 최신 기술입니다.
- PromethION 시스템은 전기 저항성 막에 삽입된 **나노포어 리더 단백질(Nanopore reader proteins)**을 통해 DNA 또는 RNA를 시퀀싱합니다.
- 초장거리 리드 (ultra-long reads) 는 반복 서열이 많은 복잡한 유전체를 효과적으로 커버하며, 유전체 조립 정확도 및 대규모 구조 변이(structural variation) 검출을 크게 향상시킵니다.
MGI
DNBSEQ-T7
- DNBSEQ-T7 플랫폼은 PE150 기준으로 1회 런당 최대 7Tb의 데이터를 생성할 수 있어, 전장 유전체 시퀀싱(Whole Genome Sequencing) 및 대규모 시퀀싱 프로젝트와 같은 데이터 집약적인 분석에 적합합니다.
- Novogene는 PE150 및 PE100 시퀀싱 옵션을 모두 제공하여, 고객의 프로젝트 요구사항에 따라 유연하고 확장 가능한 솔루션을 지원합니다.
10X GENOMICS
CHROMIUM CONTROLLER PLATFORM
- CHROMIUM CONTROLLER PLATFORM
- 이 기술의 핵심은 고도화된 마이크로플루이딕스 (microfluidics) 를 활용해 수만 개의 단일세포 분할 (single-cell partition) 을 수 분 내에 생성하고, 각 분할에 고유 바코드를 부여함으로써 후속 분석에 활용할 수 있도록 하는 능력에 있습니다.
Computing Platform
Novogene의 슈퍼컴퓨팅 인프라는 매월 수십만 건의 인간 전체 유전체(whole genome)를 분석할 수 있는 능력을 갖추고 있습니다.
이러한 컴퓨팅 역량은 당사의 압도적인 NGS 처리 능력과 완벽히 연동되어, 다양한 규모의 프로젝트를 동시에 수행하면서도 고객에게 신속하게 데이터를 제공할 수 있습니다.
최첨단 컴퓨팅 플랫폼은 다음과 같이 구성되어 있습니다:
• DELL 컴퓨팅 노드 기반
• 총 메모리 용량: 106 TB
• 연산 성능: 최대 2,480T FLOPS
• Isilon 스토리지: 25 PB 용량
또한, 스토리지 용량은 필요에 따라 확장 가능하여 고객 데이터가 항상 안전하게 백업되고, 필요 시 즉시 접근 가능하도록 보장합니다.
Falcon
지능형 운송 플랫폼