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전장유전체 바이설파이트 시퀀싱 (WGBS)
시토신의 C5 위치에서 발생하는 DNA 메틸화는 유전자 발현과 크로마틴 재구성에 있어 중요한 역할을 합니다. 메틸화 패턴의 이상은 종양 발생, 신경퇴행성 질환, 신경계 장애와 밀접한 관련이 있습니다. 메틸롬의 생정보학적 분석은 유전자 조절, 세포 분화, 발생(배아 발생 포함), 노화, 질병의 발생 및 진행, 표현형 다양성, 식물 및 동물의 진화 연구 등 다양한 연구 분야에서 널리 활용되고 있습니다.
노보진은 전장유전체 바이설파이트 염기서열 분석 (WGBS, Whole Genome Bisulfite Sequencing) 서비스를 제공하여, 단일 염기 해상도로 유전체 전반의 메틸화된 시토신을 정밀하게 식별할 수 있도록 지원합니다.
메틸롬의 깊이 있는 탐색은 유전자 발현과 후생유전학적 조절을 받는 다양한 생물학적 과정을 이해하는 데 핵심적입니다.
응용 분야 (Applications)
노보진은 고품질 데이터와 논문 게재 수준의 분석 결과를 제공하여 다음과 같은 연구를 지원합니다:
- CG, CHG 및 CHH 부위에서 단일 염기 해상도로 메틸화 패턴을 분석합니다.
- 실험 처리나 샘플 조건에 따라 달라지는 차등 메틸화 부위를 식별합니다.
- 메틸화 프로파일을 기반으로 세포 분화 또는 조직 발달의 메커니즘을 이해합니다.
- DNA 과메틸화 또는 저메틸화 탐지를 통해 질병 및 암의 조기 진단이 가능합니다.
노보진 서비스의 장점 및 특징
- Novogene는 수백 건의 프로젝트를 성공적으로 수행하였으며, 신뢰할 수 있는 전문 생물정보학 분석과 논문 게재 수준의 고품질 데이터를 지속적으로 제공합니다.
- 메틸화 라이브러리 제작에서는 극소량의 DNA 입력과 높은 바이설파이트 전환율을 지원합니다.
- 정확한 매핑 및 포괄적인 생물정보학 분석을 위해 Bismark와 같은 업계 표준 소프트웨어와 Novogene의 검증된 자체 파이프라인을 사용합니다.
- 맞춤형 연관 분석을 통해 메틸화와 유전자 발현 간의 상관관계를 탐색할 수 있습니다.
사양: DNA 샘플 요구사항
Sample Type | Required Amount | Purity |
Genomic DNA | ≥ 200 ng | A260/280=1.8-2.0 |
사양: 시퀀싱 및 분석
Platform Type | Illumina NovaSeq System |
Read Length | Paired-end 150bp |
Sequencing Depth | ≥ 30× coverage for the species with reference genome |
Standard Data Analysis |
• Data Quality Control |
프로젝트 진행 과정
노보진은 프로젝트의 모든 과정에서 최고 수준의 품질과 전문적인 서비스를 제공하여 연구자들이 신뢰할 수 있는 결과를 얻을 수 있도록 지원합니다. 모든 단계는 엄격한 과학적 기준에 따라 설계되고 수행되며, 시퀀싱 데이터의 정확성과 신뢰성을 보장하기 위해 철저한 품질 관리(QC) 절차가 적용됩니다.
전체 워크플로우는 샘플 준비 및 정량화, DNA 절단 및 라이브러리 제작, 라이브러리 품질 검증, 시퀀싱, 생물정보 분석 등의 주요 단계로 이루어져 있습니다.
Featured Publications using Novogene WGBS Service
Reference Information
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데모 리포트가 필요하신 경우, 요청 문의해 주세요.
Distribution of Genome Coverage
Methylation Level Distribution on Whole Genome
Heatmap Analysis for Methylation Levels of Gene Functional Region
Methylation Level Distribution at Functional Genetic Elements
Circos Plot for DMR Condition in Three Contexts (CG, CHG, CHH)
Diagram of GO Enrichment
크로마틴 면역침강 시퀀싱